Exportação 3D e quantificação

O que faz

A Exportação 3D e quantificação transforma um volume e a sua segmentação em produtos usados fora do visualizador: malhas de superfície para visualização e educação do paciente, imagens renderizadas e vídeos em rotação da anatomia, e medidas de volume e forma por estrutura.

Três ferramentas compõem o modelo. Mesh, a padrão, constrói uma superfície suavizada, simplificada e fechada (watertight) para cada estrutura segmentada. Render produz projeções de intensidade máxima, reformatações multiplanares e miniaturas com renderização volumétrica, vídeos MP4 em rotação e prévias em cine. Volume mede cada estrutura: volume, área de superfície, diâmetros máximos, esfericidade e estatísticas de intensidade.

Uso previsto

Visualização, comunicação e medição. As malhas apoiam o ensino e a educação do paciente, as renderizações ilustram laudos e discussões de casos, e a volumetria fornece os números que muitos modelos de TC e RM reutilizam. Miniaturas e vídeos em rotação também servem como prévias de estudos em um visualizador ou em um acervo didático.

Para quem é

Cirurgiões e radiologistas que preparam discussões de casos, docentes, pesquisadores que precisam de volumetria em coortes e desenvolvedores que querem prévias e malhas a partir das suas próprias segmentações.

Entradas aceitas

• Volume: uma série de TC ou RM em DICOM ou NIfTI.
• Segmentação: DICOM SEG ou um mapa de rótulos NIfTI com um rótulo por estrutura, do MedRun ou de qualquer outra fonte.
• Render também aceita um volume isolado, com ou sem máscaras.

Requisitos

Requisito	Motivo
Segmentação na mesma grade do volume	Malhas e medidas são posicionadas no espaço do paciente
Espaçamento correto dos voxels	Volumes, áreas e diâmetros são tão bons quanto o espaçamento
Estruturas rotuladas	Cada malha e cada medida recebe o nome da sua estrutura

O espaçamento dos voxels e a geometria são verificados pela etapa de inspeção DICOM antes do cálculo de qualquer valor. A suavização é limitada para que estruturas finas mantenham a sua forma na malha.

Contexto opcional

O formato da malha (STL, OBJ ou 3MF) e as estruturas a incluir são escolhidos em options.

O resultado

Cada ferramenta retorna o seu próprio resultado. A execução padrão retorna as malhas.

Ferramenta	Conteúdo
Mesh (padrão)	Superfície suavizada, simplificada e fechada por estrutura em STL, OBJ ou 3MF, opcionalmente encapsulada em DICOM
Render	Miniaturas em MIP, MPR e renderização volumétrica, vídeos MP4 em rotação e prévias em cine
Volume	Volume, área de superfície, diâmetros máximos, esfericidade e estatísticas de intensidade por estrutura

Padrões

• Malhas: Encapsulated STL, OBJ e MTL Storage; Surface Segmentation Storage; arquivos STL, OBJ e 3MF simples.
• Medidas: Comprehensive 3D SR com o TID 1500 Measurement Report.
• Renderizações: PNG e MP4, ou DICOM Secondary Capture para o PACS.

Ferramentas relacionadas

• utils/3d/mesh: segmentação em malhas de superfície; a execução padrão.
• utils/3d/render: prévias, projeções e vídeos em rotação de um volume.
• utils/3d/volume: medidas de volume e forma por estrutura.

Notas de medição

Volumes e diâmetros são calculados a partir da segmentação como recebida, de modo que a sua qualidade acompanha a qualidade das máscaras e do espaçamento dos voxels. Máscaras de modelos do MedRun e máscaras desenhadas em outras ferramentas são medidas da mesma forma.