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utils/3d

Exportación 3D y cuantificación

Segmentaciones convertidas en mallas STL y OBJ, renderizados 3D, videos en rotación y volúmenes.

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Descripción general

Qué hace

El modelo Exportación 3D y cuantificación convierte un volumen y su segmentación en elementos que se usan fuera del visor: mallas de superficie para la visualización y la educación del paciente, imágenes renderizadas y videos en rotación de la anatomía, y mediciones de volumen y forma por estructura.

Tres herramientas componen el modelo. Mesh, la predeterminada, construye una superficie suavizada, diezmada y estanca para cada estructura segmentada. Render genera proyecciones de máxima intensidad, reconstrucciones multiplanares y miniaturas de renderizado de volumen, videos MP4 en rotación y vistas previas de cine. Volume mide cada estructura: volumen, área de superficie, diámetros máximos, esfericidad y estadísticas de intensidad.

Uso previsto

Visualización, comunicación y medición. Las mallas sirven para la docencia y la educación del paciente, los renderizados ilustran informes y sesiones clínicas, y la volumetría aporta las cifras que reutilizan muchos modelos de TC y RM. Las miniaturas y los videos en rotación sirven también como vista previa de los estudios en un visor o en una biblioteca docente.

A quién va dirigido

Cirujanos y radiólogos que preparan sesiones clínicas, docentes, investigadores que necesitan volumetrías en cohortes y desarrolladores que quieren vistas previas y mallas a partir de sus propias segmentaciones.

Entradas y protocolo

Entradas admitidas

  • Volumen: una serie de TC o RM en DICOM o NIfTI.
  • Segmentación: DICOM SEG o un mapa de etiquetas NIfTI con una etiqueta por estructura, de MedRun o de cualquier otra fuente.
  • Render también admite un volumen solo, con o sin máscaras.

Requisitos

Requisito Motivo
Segmentación en la misma rejilla que el volumen Las mallas y las mediciones se sitúan en el espacio del paciente
Tamaño de vóxel correcto La exactitud de los volúmenes, las áreas y los diámetros depende del espaciado
Estructuras etiquetadas Cada malla y cada medición llevan el nombre de su estructura

El tamaño de vóxel y la geometría se comprueban con el paso de inspección DICOM antes de calcular ningún valor. El suavizado se limita para que las estructuras finas conserven su forma en la malla.

Contexto opcional

El formato de la malla (STL, OBJ o 3MF) y las estructuras que se incluyen se eligen en options.

Resultados y estándares

El resultado

Cada herramienta devuelve su propio resultado. La ejecución predeterminada devuelve las mallas.

Herramienta Contenido
Mesh (predeterminada) Superficie suavizada, diezmada y estanca por estructura en STL, OBJ o 3MF, opcionalmente encapsulada en DICOM
Render Miniaturas MIP, MPR y de renderizado de volumen, videos MP4 en rotación y vistas previas de cine
Volume Volumen, área de superficie, diámetros máximos, esfericidad y estadísticas de intensidad por estructura

Estándares

  • Mallas: Encapsulated STL, OBJ y MTL Storage; Surface Segmentation Storage; archivos STL, OBJ y 3MF simples.
  • Mediciones: Comprehensive 3D SR con el TID 1500 Measurement Report.
  • Renderizados: PNG y MP4, o DICOM Secondary Capture para el PACS.

Herramientas relacionadas

  • utils/3d/mesh: de la segmentación a mallas de superficie; la ejecución predeterminada.
  • utils/3d/render: vistas previas, proyecciones y videos en rotación de un volumen.
  • utils/3d/volume: mediciones de volumen y forma por estructura.

Notas sobre las mediciones

Los volúmenes y los diámetros se calculan a partir de la segmentación tal como se aporta, por lo que su calidad depende de la calidad de las máscaras y del tamaño de vóxel. Las máscaras de los modelos de MedRun y las dibujadas con otras herramientas se miden de la misma forma.

Secciones del resultado

Cada ejecución devuelve todas las secciones que admite su entrada.

    Ver todos los modelos de Utilidades

    Herramientas DICOM

    Inspección de un estudio DICOM, conversión a NIfTI, PNG o MP4 y validación de objetos DICOM.

    Whole body0 sections
    UTIL· image-2d

    Registro de imágenes

    Alineación de dos series o estudios: transformación rígida, afín o deformable, remuestreo y control.

    Whole body2 sections
    UTIL· image-2d