DICOM-Tools
DICOM-Untersuchung prüfen, in NIfTI, PNG oder MP4 konvertieren und DICOM-Objekte validieren.
Zwei Serien oder Untersuchungen ausrichten: starr, affin oder deformierbar, mit Qualitätsprüfung.
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Bildregistrierung richtet zwei Bilder aneinander aus: ein feststehendes und ein bewegtes, aus derselben oder aus unterschiedlichen Modalitäten. Sie ist der Schritt hinter jedem Verlaufsvergleich, vom onkologischen Restaging über die MRT-Verlaufskontrolle des Schädels bis zum Vergleich mit einem früheren Thorax-CT, und hinter der multimodalen Fusion wie MRT auf CT.
Die Standardanalyse berechnet eine starre oder affine Transformation, die sichere Wahl für die meisten Vergleiche. Die deformierbare Registrierung ist optional und liefert ein Verschiebungsfeld mit einer Faltungsprüfung. Jede Analyse liefert zudem das bewegte Bild, auf das feststehende umgerechnet, weil nur wenige PACS Registrierungsobjekte allein darstellen.
Technische Unterstützung für Vergleich und Fusion: eine Voruntersuchung in denselben Raum wie die aktuelle bringen, eine zweite Modalität für Befundung oder Planung fusionieren und Regions of Interest von einem Zeitpunkt auf den nächsten übertragen. Ein deformierbares Feld kann echtes Wachstum verdecken, wenn es unbedacht zur Messung von Veränderungen genutzt wird, daher ist die starre oder affine Ausrichtung die Voreinstellung und die deformierbare Registrierung eine bewusste Wahl.
Radiologen und Onkologen, die Untersuchungen im Verlauf vergleichen, Strahlentherapie- und Nuklearmedizinteams, die Modalitäten fusionieren, Forschende mit longitudinalen Analysen und Entwickler, die eine Ausrichtung in eigenen Pipelines benötigen.
files und eine Voruntersuchung in prior_files, für das
unten beschriebene longitudinale Tool.| Anforderung | Grund |
|---|---|
| Korrekter Abstand, Position und Orientierung in beiden Bildern | Die Transformation wird im Patientenkoordinatensystem berechnet |
| Überlappende Anatomie | Die Registrierung benötigt gemeinsame Strukturen zum Abgleich |
| Ähnliche Phase bei deformierbaren Analysen | Unterschiedliche Kontrastmittelphasen oder Atemlagen können als Deformation fehlgedeutet werden |
Unterschiedliche Bildfelder zwischen Untersuchungen und große anatomische Veränderungen nach Operation oder Gewichtsverlust mindern die Registrierungsqualität; die Qualitätsprüfungen weisen dies aus.
options.transform wählt starr, affin oder deformierbar. Ohne diese Angabe ist die Analyse starr oder affin.
Ein Ergebnis pro Bildpaar: die Transformation, das umgerechnete bewegte Bild und Qualitätsprüfungen.
| Abschnitt | Inhalt |
|---|---|
| Starre und affine Registrierung | Starre oder affine Transformation und das auf das feststehende Bild umgerechnete bewegte Bild |
| Deformierbare Registrierung | Verschiebungsfeld, verformtes Bild und eine Faltungsprüfung auf Basis der Jacobi-Determinante |
utils/register/align: die auf dieser Seite beschriebene paarweise Analyse.utils/register/longitudinal: aktuelle Untersuchung und Voruntersuchung als Eingabe, zugeordnete Serienpaare als
Ausgabe, entlang der Körperachse anhand eines Körperregion-Scores ausgerichtet, starr und optional deformierbar
registriert; die Transformation wird als DICOM REG geliefert, übertragene Masken und Regions of Interest
als SEG.Die Faltungsprüfung gibt an, wo die Jacobi-Determinante des Verschiebungsfelds null oder negativ ist, also wo die Deformation Gewebe auf sich selbst faltet; solche Regionen werden gekennzeichnet, damit dort keine Veränderung gemessen wird.
Eine Analyse liefert alle Abschnitte, die ihre Eingabe zulässt.
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3D-Export und Quantifizierung
Segmentierungen als STL- und OBJ-Meshes, 3D-Renderings und rotierende Videos sowie Volumenmessungen.