Herramientas DICOM
Inspección de un estudio DICOM, conversión a NIfTI, PNG o MP4 y validación de objetos DICOM.
Alineación de dos series o estudios: transformación rígida, afín o deformable, remuestreo y control.
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El modelo Registro de imágenes alinea dos imágenes: una fija y una móvil, de la misma o de distinta modalidad. Es el paso que hay detrás de toda comparación de seguimiento, desde la reestadificación oncológica hasta el seguimiento con RM cerebral y la TC de tórax previa, y detrás de la fusión multimodal, como la RM sobre la TC.
La ejecución predeterminada calcula una transformación rígida o afín, la opción segura para la mayoría de las comparaciones. El registro deformable es opcional y devuelve un campo de desplazamiento con una comprobación de plegamiento. Cada ejecución devuelve además la imagen móvil remuestreada sobre la fija, porque pocos PACS muestran por sí solos los objetos de registro.
Apoyo técnico para la comparación y la fusión: situar un estudio previo en el mismo espacio que el actual, fusionar una segunda modalidad para su revisión o planificación, y propagar regiones de interés de un momento temporal al siguiente. Un campo deformable puede ocultar un crecimiento real si se usa sin cuidado para medir cambios, por lo que la alineación rígida o afín es la predeterminada y el registro deformable se elige de forma deliberada.
Radiólogos y oncólogos que comparan estudios a lo largo del tiempo, equipos de radioterapia y de medicina nuclear que fusionan modalidades, investigadores que realizan análisis longitudinales y desarrolladores que necesitan alineación dentro de sus propios flujos.
files y uno previo en prior_files, para la herramienta longitudinal
descrita más abajo.| Requisito | Motivo |
|---|---|
| Espaciado, posición y orientación correctos en ambas imágenes | La transformación se calcula en el espacio del paciente |
| Anatomía superpuesta | El registro necesita estructuras comunes que emparejar |
| Fase similar en los registros deformables | Las distintas fases de contraste o de respiración pueden confundirse con deformación |
Los campos de visión distintos entre estudios y los grandes cambios anatómicos tras una cirugía o una pérdida de peso reducen la calidad del registro; los controles de calidad lo indican.
options.transform selecciona rígido, afín o deformable. Sin ella, la ejecución es rígida o afín.
Un resultado por par: la transformación, la imagen móvil remuestreada y los controles de calidad.
| Sección | Contenido |
|---|---|
| Registro rígido y afín | Transformación rígida o afín y la imagen móvil remuestreada sobre la fija |
| Registro deformable | Campo de desplazamiento, imagen deformada y una comprobación de plegamiento basada en el jacobiano |
utils/register/align: la ejecución por pares descrita en esta página.utils/register/longitudinal: entra un estudio actual y uno previo y salen pares de series emparejados, alineados a
lo largo del eje corporal por puntuación de región anatómica, registrados de forma rígida y opcionalmente deformable;
la transformación se entrega como DICOM REG y las máscaras y regiones de interés propagadas como SEG.La comprobación de plegamiento indica dónde el determinante jacobiano del campo de desplazamiento es cero o negativo, es decir, dónde la deformación pliega el tejido sobre sí mismo; esas regiones se señalan para que no se midan cambios en ellas.
Cada ejecución devuelve todas las secciones que admite su entrada.
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Exportación 3D y cuantificación
Segmentaciones convertidas en mallas STL y OBJ, renderizados 3D, videos en rotación y volúmenes.