Patología de la biopsia de próstata
Biopsia de próstata: cáncer por cilindro, Gleason y grado ISUP, % de patrón 4 y longitud tumoral.
Biopsia y resección pulmonar: subtipo de CPCNP, grado IASLC, PD-L1 TPS y probabilidad de EGFR.
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El modelo Patología del cáncer de pulmón analiza las preparaciones de H&E de una biopsia o una resección pulmonar, junto con una tinción inmunohistoquímica de PD-L1 cuando se carga. Las biopsias pulmonares son pequeñas, y cada corte destinado a IHQ o PCR es tejido que se pierde para la secuenciación de nueva generación (NGS); la lectura está pensada para sacar el máximo partido de las preparaciones ya realizadas.
En la H&E, la ejecución distingue adenocarcinoma, carcinoma escamoso y otros carcinomas. En el adenocarcinoma infiltrante no mucinoso da el porcentaje de cada patrón de crecimiento (lepídico, acinar, papilar, micropapilar, sólido, cribiforme) y el grado IASLC. En la preparación de PD-L1 calcula el tumor proportion score (TPS) con una superposición de las células tumorales positivas. Una probabilidad de mutación EGFR a partir de la H&E prioriza el caso para el estudio molecular rápido.
Apoyo a la decisión clínica en la subtipificación y el estudio de biomarcadores del cáncer de pulmón de células no pequeñas (CPCNP). La probabilidad de EGFR ayuda a decidir qué casos van primero a PCR rápida o NGS, y el TPS se informa con su clon y su ensayo.
Patólogos torácicos y patólogos quirúrgicos generales, residentes y comités moleculares de tumores que planifican los estudios con tejido escaso. Los desarrolladores llaman a la ejecución para añadir resultados estructurados de cáncer de pulmón a un sistema de información de laboratorio o a un flujo de preselección para ensayos clínicos.
| Requisito | Motivo |
|---|---|
| Tinción y marcador por preparación | Las preparaciones de H&E y de PD-L1 van a partes distintas de la lectura |
| Clon de PD-L1 en los metadatos o en la carga | Los rangos de TPS siguen los puntos de corte de 22C3, y la puntuación se informa con su ensayo |
| Tamaño de píxel en µm/px | Las áreas de los patrones y las densidades celulares se calculan por mm² |
| Tumor viable suficiente | Las biopsias pequeñas con artefacto de aplastamiento dan un subtipo y un TPS de baja confianza, señalados en los indicadores de calidad |
La historia clínica y la pregunta que se quiere responder (diagnóstico, elegibilidad para inmunoterapia, planificación
molecular) se pueden indicar en clinical_context para orientar las recomendaciones y el borrador de informe.
Un resultado JSON para el caso, organizado en secciones.
| Sección | Contenido |
|---|---|
| Subtipo y grado IASLC | Adenocarcinoma, carcinoma escamoso u otro carcinoma; porcentajes de los patrones del adenocarcinoma y grado IASLC |
| PD-L1 TPS | Tumor proportion score en el rango <1 %, 1–49 % o ≥50 %, con superposición de las células tumorales positivas |
| Probabilidad de mutación EGFR | Probabilidad de mutación EGFR a partir de la H&E en el adenocarcinoma |
| Borrador de informe | Opcional (options.report): una narrativa en inglés que interpreta el resultado para el lector (hallazgos, impresión, limitaciones); cada cifra se contrasta con los hallazgos |
DiagnosticReport con entradas Observation codificadas en LOINC.El grado IASLC se aplica al adenocarcinoma infiltrante no mucinoso. Combina el patrón predominante con la cantidad de patrones de alto grado (sólido, micropapilar, glandular complejo o cribiforme): el grado 1 es de predominio lepídico y el grado 2 de predominio acinar o papilar, ambos con menos del 20 % de patrón de alto grado; el grado 3 es cualquier tumor con un 20 % o más de patrón de alto grado.
Cada ejecución devuelve todas las secciones que admite su entrada.
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