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Patologia do câncer de pulmão

Biópsia e ressecção pulmonar: subtipo de CPCNP, grau IASLC, PD-L1 TPS e probabilidade de EGFR.

Em breveWSIPatologia digital

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Visão geral

O que faz

A Patologia do câncer de pulmão lê as lâminas de HE de uma biópsia ou ressecção pulmonar, junto com uma imuno-histoquímica de PD-L1 quando enviada. As biópsias pulmonares são pequenas, e cada corte feito para IHQ ou PCR é tecido perdido para o sequenciamento de nova geração; a leitura foi pensada para extrair o máximo das lâminas já feitas.

Na HE, a execução separa adenocarcinoma, carcinoma de células escamosas e outros carcinomas. No adenocarcinoma invasivo não mucinoso, ela fornece a porcentagem de cada padrão de crescimento (lepídico, acinar, papilífero, micropapilífero, sólido, cribriforme) e o grau IASLC. Na lâmina de PD-L1, ela calcula o tumor proportion score (TPS) com uma sobreposição das células tumorais positivas. Uma probabilidade de mutação EGFR a partir da HE prioriza o caso para o teste molecular rápido.

Uso previsto

Apoio à decisão na subtipagem e na investigação de biomarcadores no câncer de pulmão de não pequenas células (CPCNP). A probabilidade de EGFR ajuda a decidir quais casos vão primeiro para a PCR rápida ou o NGS, e o TPS é informado com o seu clone e ensaio.

Para quem é

Patologistas torácicos e patologistas cirúrgicos gerais, residentes e reuniões multidisciplinares moleculares que planejam testes com tecido escasso. Desenvolvedores chamam a execução para acrescentar resultados estruturados de câncer de pulmão a um LIS ou a um pipeline de pré-triagem para ensaios clínicos.

Entradas e protocolo

Entradas aceitas

  • HE: lâminas digitais de uma biópsia pequena ou de uma ressecção.
  • IHQ de PD-L1: uma lâmina do mesmo tumor, com o clone do anticorpo informado.
  • Formatos: DICOM VL Whole Slide Microscopy Image, ou arquivos do fabricante SVS, NDPI, MRXS, iSyntax, SCN, BIF, CZI e OME-TIFF.

Requisitos

Requisito Motivo
Coloração e marcador por lâmina As lâminas de HE e de PD-L1 vão para partes diferentes da leitura
Clone do PD-L1 nos metadados ou no envio As faixas de TPS seguem os pontos de corte do 22C3, e o escore é informado com o seu ensaio
Espaçamento de pixel em µm/px As áreas dos padrões e as densidades celulares são calculadas por mm²
Tumor viável suficiente Biópsias pequenas com artefato de esmagamento dão subtipo e TPS de baixa confiança, sinalizados na qualidade

Contexto opcional

A história clínica e a pergunta a responder (diagnóstico, elegibilidade para imunoterapia, planejamento molecular) podem ir em clinical_context para orientar as recomendações e o rascunho de laudo.

Resultados e padrões

O resultado

Um resultado JSON para o caso, organizado em seções.

Seção Conteúdo
Subtipo e grau IASLC Adenocarcinoma, carcinoma escamoso ou outro carcinoma; porcentagens dos padrões do adenocarcinoma e grau IASLC
PD-L1 TPS Tumor proportion score na faixa <1 %, 1–49 % ou ≥50 %, com sobreposição das células tumorais positivas
Probabilidade de mutação EGFR Probabilidade de mutação EGFR a partir da HE no adenocarcinoma
Rascunho de laudo Opcional (options.report): uma narrativa em inglês que interpreta o resultado para o leitor (achados, impressão, limitações); cada número é conferido com os achados

Padrões

  • Classificação: WHO Classification of Thoracic Tumours, 5ª edição; graduação IASLC 2020 do adenocarcinoma invasivo não mucinoso.
  • PD-L1: pontos de corte do TPS 22C3 <1 %, 1–49 % e ≥50 %.
  • Laudo: protocolo do CAP para câncer de pulmão.
  • DICOM e HL7: mapas de padrões e de tumor como Segmentation, células pontuadas como Microscopy Bulk Simple Annotations, escores em SR TID 1500; FHIR R4 DiagnosticReport com entradas Observation codificadas em LOINC.

Grau IASLC

O grau IASLC se aplica ao adenocarcinoma invasivo não mucinoso. Ele combina o padrão predominante com a quantidade de padrões de alto grau (sólido, micropapilífero, glandular complexo ou cribriforme): o grau 1 é predominantemente lepídico e o grau 2 predominantemente acinar ou papilífero, cada um com menos de 20 % de padrão de alto grau; o grau 3 é qualquer tumor com 20 % ou mais de padrão de alto grau.

Seções do resultado

Uma execução retorna todas as seções que a entrada permite.

  1. Subtipo e grau IASLCsubtype
  2. PD-L1 TPSpd-l1
  3. Probabilidade de mutação EGFRegfr
  4. Rascunho de laudoreport
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