Patologia de biópsia de próstata
Biópsia de próstata: câncer por fragmento, Gleason e grau ISUP, % de padrão 4 e extensão tumoral.
Biópsia e ressecção pulmonar: subtipo de CPCNP, grau IASLC, PD-L1 TPS e probabilidade de EGFR.
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A Patologia do câncer de pulmão lê as lâminas de HE de uma biópsia ou ressecção pulmonar, junto com uma imuno-histoquímica de PD-L1 quando enviada. As biópsias pulmonares são pequenas, e cada corte feito para IHQ ou PCR é tecido perdido para o sequenciamento de nova geração; a leitura foi pensada para extrair o máximo das lâminas já feitas.
Na HE, a execução separa adenocarcinoma, carcinoma de células escamosas e outros carcinomas. No adenocarcinoma invasivo não mucinoso, ela fornece a porcentagem de cada padrão de crescimento (lepídico, acinar, papilífero, micropapilífero, sólido, cribriforme) e o grau IASLC. Na lâmina de PD-L1, ela calcula o tumor proportion score (TPS) com uma sobreposição das células tumorais positivas. Uma probabilidade de mutação EGFR a partir da HE prioriza o caso para o teste molecular rápido.
Apoio à decisão na subtipagem e na investigação de biomarcadores no câncer de pulmão de não pequenas células (CPCNP). A probabilidade de EGFR ajuda a decidir quais casos vão primeiro para a PCR rápida ou o NGS, e o TPS é informado com o seu clone e ensaio.
Patologistas torácicos e patologistas cirúrgicos gerais, residentes e reuniões multidisciplinares moleculares que planejam testes com tecido escasso. Desenvolvedores chamam a execução para acrescentar resultados estruturados de câncer de pulmão a um LIS ou a um pipeline de pré-triagem para ensaios clínicos.
| Requisito | Motivo |
|---|---|
| Coloração e marcador por lâmina | As lâminas de HE e de PD-L1 vão para partes diferentes da leitura |
| Clone do PD-L1 nos metadados ou no envio | As faixas de TPS seguem os pontos de corte do 22C3, e o escore é informado com o seu ensaio |
| Espaçamento de pixel em µm/px | As áreas dos padrões e as densidades celulares são calculadas por mm² |
| Tumor viável suficiente | Biópsias pequenas com artefato de esmagamento dão subtipo e TPS de baixa confiança, sinalizados na qualidade |
A história clínica e a pergunta a responder (diagnóstico, elegibilidade para imunoterapia, planejamento molecular)
podem ir em clinical_context para orientar as recomendações e o rascunho de laudo.
Um resultado JSON para o caso, organizado em seções.
| Seção | Conteúdo |
|---|---|
| Subtipo e grau IASLC | Adenocarcinoma, carcinoma escamoso ou outro carcinoma; porcentagens dos padrões do adenocarcinoma e grau IASLC |
| PD-L1 TPS | Tumor proportion score na faixa <1 %, 1–49 % ou ≥50 %, com sobreposição das células tumorais positivas |
| Probabilidade de mutação EGFR | Probabilidade de mutação EGFR a partir da HE no adenocarcinoma |
| Rascunho de laudo | Opcional (options.report): uma narrativa em inglês que interpreta o resultado para o leitor (achados, impressão, limitações); cada número é conferido com os achados |
DiagnosticReport com entradas Observation codificadas em LOINC.O grau IASLC se aplica ao adenocarcinoma invasivo não mucinoso. Ele combina o padrão predominante com a quantidade de padrões de alto grau (sólido, micropapilífero, glandular complexo ou cribriforme): o grau 1 é predominantemente lepídico e o grau 2 predominantemente acinar ou papilífero, cada um com menos de 20 % de padrão de alto grau; o grau 3 é qualquer tumor com 20 % ou mais de padrão de alto grau.
Uma execução retorna todas as seções que a entrada permite.
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