Patologia colorretal

O que faz

A Patologia colorretal lê as lâminas de HE de polipectomias colorretais, biópsias e ressecções de câncer, os espécimes de maior volume da patologia gastrointestinal. No pólipo, a histologia define o intervalo de vigilância colonoscópica; no câncer, a pesquisa universal de MSI ou de deficiência do sistema de reparo de pareamento (MMR) é o padrão das diretrizes.

Nos pólipos, a execução classifica adenoma tubular, tubuloviloso e viloso, lesão serrilhada séssil e pólipo hiperplásico, e gradua a displasia. No carcinoma, ela retorna a probabilidade de MSI-high/dMMR a partir da HE e um mapa tecidual de nove classes (tumor, estroma, linfócitos, necrose e debris, mucosa normal, músculo, tecido adiposo, muco, fundo) com a razão tumor–estroma.

Uso previsto

Apoio à decisão: um segundo olhar sobre a distinção entre serrilhado e hiperplásico e sobre o grau de displasia, e uma probabilidade de MSI que coloca os cânceres provavelmente MSI-high em primeiro lugar na fila da imuno-histoquímica de MMR ou da PCR de MSI. Pólipos cortados tangencialmente e biópsias pequenas são os casos difíceis.

Para quem é

Patologistas gastrointestinais e patologistas cirúrgicos gerais, residentes e programas de rastreamento com grande volume de pólipos. Desenvolvedores usam a execução para dados estruturados de pólipos em um LIS ou para auditorias do diagnóstico óptico versus histológico.

Entradas aceitas

• Pólipos e biópsias: uma ou mais lâminas digitais de HE por espécime; vários pólipos podem ser enviados como partes separadas de um mesmo caso.
• Ressecções: lâminas de HE do tumor, para a probabilidade de MSI e o mapa tecidual.
• Formatos: DICOM VL Whole Slide Microscopy Image ou arquivos de lâmina do fabricante (Aperio SVS, Hamamatsu NDPI, 3DHISTECH MRXS, Philips iSyntax, Leica SCN, Ventana BIF, Zeiss CZI, OME-TIFF).

Requisitos

Requisito	Motivo
Coloração HE	As três seções leem a morfologia em HE
Espaçamento de pixel em µm/px	As áreas das classes teciduais e a razão tumor–estroma são medidas em mm²
Identificação da parte por pólipo	A histologia é informada por pólipo, correspondendo ao local da colonoscopia

Contexto opcional

A localização do pólipo, os achados endoscópicos ou a pergunta clínica podem ser enviados em clinical_context.

O resultado

Seção	Conteúdo
Histologia do pólipo	Adenoma tubular, tubuloviloso ou viloso, lesão serrilhada séssil ou pólipo hiperplásico, com grau de displasia
Predição de MSI	Probabilidade de MSI-high/dMMR a partir da HE no carcinoma
Mapa tecidual	Segmentação tecidual em nove classes com as áreas das classes e a razão tumor–estroma
Rascunho de laudo	Opcional (options.report): uma narrativa em inglês que interpreta o resultado para o leitor (achados, impressão, limitações); cada número é conferido com os achados

Padrões

• Classificação: WHO Classification of Digestive System Tumours, 5ª edição; Revised Vienna classification of GI epithelial neoplasia.
• Biomarcador: recomendações ESMO 2019 sobre a pesquisa de MSI e dMMR.
• Laudo: protocolo do CAP para câncer de cólon e reto.
• DICOM: mapa tecidual como Label Map Segmentation e medidas em SR TID 1500; FHIR R4 DiagnosticReport e IHE PaLM APSR para exportação ao LIS.

Funciona com

O resultado da histologia do pólipo se combina com a caracterização de pólipos do modelo de Colonoscopia (endo/colonoscopy), para comparar o diagnóstico óptico da colonoscopia gravada com a histologia final.