Kolorektal Patoloji

Ne yapar

Kolorektal Patoloji, gastrointestinal patolojinin en yüksek hacimli spesmenleri olan kolorektal polipektomi materyalleri, biyopsiler ve kanser rezeksiyonlarının H&E lamlarını değerlendirir. Bir polipte histoloji kolonoskopi sürveyans aralığını belirler; bir kanserde ise evrensel MSI veya mismatch repair (MMR) testi kılavuz standardıdır.

Poliplerde çalıştırma tübüler, tübülovillöz ve villöz adenomu, sesil serrated lezyonu ve hiperplastik polibi sınıflar ve displaziyi derecelendirir. Karsinomda H&E'den MSI-yüksek/dMMR olasılığını ve tümör–stroma oranıyla dokuz sınıflı bir doku haritasını (tümör, stroma, lenfositler, nekroz ve debris, normal mukoza, kas, yağ dokusu, müsin, zemin) döndürür.

Kullanım amacı

Karar desteği: serrated ve hiperplastik ayrımına ve displazi derecesine ikinci bir bakış ve olası MSI-yüksek kanserleri MMR immünohistokimyası veya MSI PCR sırasında öne alan bir MSI olasılığı. Teğetsel kesilmiş polipler ve küçük biyopsiler zor olgulardır.

Kimler için

Gastrointestinal ve genel patologlar, asistanlar ve yüksek polip hacmine sahip tarama programları. Geliştiriciler çalıştırmayı bir laboratuvar bilgi sisteminde yapılandırılmış polip verisi için veya optik ve histolojik tanı karşılaştırma denetimleri için kullanır.

Kabul edilen girdiler

• Polipler ve biyopsiler: spesmen başına bir veya daha fazla H&E tüm lam görüntüsü; birden çok polip, tek bir olgunun ayrı parçaları olarak yüklenebilir.
• Rezeksiyonlar: MSI olasılığı ve doku haritası için tümörün H&E lamları.
• Biçimler: DICOM VL Whole Slide Microscopy Image veya üretici lam dosyaları (Aperio SVS, Hamamatsu NDPI, 3DHISTECH MRXS, Philips iSyntax, Leica SCN, Ventana BIF, Zeiss CZI, OME-TIFF).

Gereksinimler

Gereksinim	Neden
H&E boyası	Üç bölümün tamamı H&E morfolojisini değerlendirir
µm/px cinsinden piksel aralığı	Doku sınıfı alanları ve tümör–stroma oranı mm² cinsinden ölçülür
Her polip için parça etiketi	Histoloji, kolonoskopideki lokalizasyonla eşleşecek şekilde polip başına bildirilir

İsteğe bağlı bağlam

Polip lokalizasyonu, endoskopik bulgular veya klinik soru clinical_context alanında iletilebilir.

Sonuç

Bölüm	İçerik
Polip histolojisi	Displazi derecesiyle tübüler, tübülovillöz veya villöz adenom, sesil serrated lezyon veya hiperplastik polip
MSI tahmini	Karsinomda H&E'den MSI-yüksek/dMMR olasılığı
Doku haritası	Sınıf alanları ve tümör–stroma oranıyla dokuz sınıflı doku segmentasyonu
Taslak rapor	İsteğe bağlı (options.report): sonucu raporlayan hekim için yorumlayan İngilizce bir anlatı metni (bulgular, kanaat, kısıtlılıklar); her sayı bulgularla karşılaştırılarak denetlenir

Standartlar

• Sınıflama: WHO Classification of Digestive System Tumours 5. baskı; gastrointestinal epitelyal neoplazinin revize Viyana sınıflaması.
• Biyobelirteç: MSI ve dMMR testine ilişkin ESMO 2019 önerileri.
• Raporlama: CAP kolon ve rektum kanseri protokolü.
• DICOM: doku haritası Label Map Segmentation olarak ve ölçümler SR TID 1500 içinde; laboratuvar bilgi sistemine aktarım için FHIR R4 DiagnosticReport ve IHE PaLM APSR.

Birlikte çalıştığı modeller

Polip histolojisi sonucu, kaydedilmiş kolonoskopiden gelen optik tanıyı nihai histolojiyle karşılaştırmak için Kolonoskopi modelinin (endo/colonoscopy) polip karakterizasyonuyla eşleşir.